种植作物要求施肥必须使足够数量的有机物质返回土壤，以保持或增加土壤微生物活性。所有有机或无机（矿质）肥料，尤其是富含氮的肥料，应以对环境和作物（营养、味道、品质和植物抗性）不产生不良后果为原则。
一、AA级绿色食品的肥料使用准则 AA级绿色食品：系指在生态环境质量符合规定的产地，生产过程中不使用任何化学合成物质，按特定的生产操作规程生产、加工、产品质量及包装经检测、检查符合特定标准，并经专门机构认定，许可使用AA级绿色食品标志的产品。
1．用绿色食品标准规定允许使用的肥料种类，禁止使用其他化肥，禁止使用有害的城市垃圾和污泥。医院的粪便垃圾和含有害特质（如毒气、病原微生物、重金属等）的工业垃圾，一律不得收集作生产绿色食品的肥料。
2．秆还田可因地制宜地进行。绿肥利用形式有覆盖、翻入土中与混合堆沤。绿肥最好在盛花期翻压，翻埋深度为15厘米左右。盖土要严，翻后耙匀。压青后15??20天才能进行播种或移苗。
3．腐熟达到无害要求的沼气肥水及腐熟的人畜粪尿可用作追肥，严禁在蔬菜等作上浇不腐熟的人粪尿。
4．饼肥对水果蔬菜等作物品种有较好的作用。
5．叶面肥料，喷施于作物叶片，可施互次或多次，最后一次必须在收获前20天喷施。
6．微生物肥料可用于拌种，也可作基肥和追肥施用，使用时应严格按照使用说明书的要求操作。微生物肥料对减少蔬菜硝酸盐含量、改善品质有显效果。可在蔬菜上有计划地扩大使用。
二、A级绿色食品的肥料使用准则 A级绿色食品：系指在生态环境质量符合规定标准的产地，生产过程中允许限量使用限定化学合成物质，按特定的生产操作规程生产、加工、产品质量及包装经检测、检查符合特定标准，并经专门机构认定，许可使用A级绿色食品标志的产品。
1、选用绿色食品标准规定允许使用的肥料种类。如生产上实属必须，允许生产基地有限度地使用部分化肥，但禁止使用硝态氮肥。
2、化肥必须与有机肥配合使用，有机氮与无机氮之比以1比1为宜，厩肥大约1000千克加尿素20千克（厩肥作基肥，尿素可作基肥和追肥用）。最后一次追肥必须在收获前30天进行。
3、化肥也可以和有机肥、微生物肥配合使用。城市垃圾要经过无害化处理，质量达到国家标准后才能使用，每年每亩农田限制用量，粘性土壤不超过300千克，砂性土壤不超过2000千克。
4、秸秆还田及其他使用准则，同AA级绿色食品的肥料使用准则。
