温度。生物农药的田间防效随着温度升高或降低而变化。如真菌球孢白僵菌防治鳞翅目害虫所需温度在为23—26℃；防治地下害虫蛴螬、蝼蛄的布氏白僵菌为22—25℃，防治效果达80％以上。细菌苏云金杆菌（Bt）对鳞翅目害虫田间温度控制在25—28℃。植物性生物农药烟碱制剂、楝素制剂田间应用温度20—33℃防效达85％以上。因此冬天使用植物性农药应把水温调到20℃以上。
湿度。田间湿度过低不利生物菌孢子的萌发。在莱氏野村菌自然寄生害虫的效果调查中发现，两块相邻的菜地，一块浇过水，另一块没有浇水，浇水的一块菜青虫、斜纹夜蛾及甜菜夜蛾几乎全被莱氏野村菌感染寄生死亡；而未浇水的一块菜地自然寄生率不到25％。因此在使用真菌、细菌类生物农药时，最好在防治前先喷水或在下雨后应用。
风雨。大风天气使用生物农药，菌粒和水剂雾滴易被吹散，降低寄生害虫的效果；植物性农药因受大风影响而分散失效。降雨会把药剂冲走，降低药效。所以露地栽培在大风、降雨的情况下不应使用生物农药。
阳光。由于紫外线的照射，会导致细菌、真菌类微生物杀虫剂在阳光照射下降解失效，因此生物农药不宜在强阳光下使用，而应在晴天的下午3—4点以后至露水前喷施。
化学农药。化学农药对生物农药真菌、细菌孢子、菌丝、芽孢生长有抑制作用。有机磷类抑制真菌菌丝生长及孢子发育达90％，如敌敌畏达100％。所以配制生物农药最好不要与化学农药混配，以免降低药效。使用过化学农药的喷雾器应在清洗后再装生物农药。
水。稀释生物农药的水应以清洁的河水井水为好。
