稻田养殖的泥鳅，一般在水稻即将黄熟之时捕捞，也可在水稻收割后进行。捕捞方法一般有以下五种：
1、网捕法：在稻谷收割之前，先用三角网设置在稻田排水口，然后排放田水，泥鳅随水而下时被捕获。此法一次难以捕尽，可重新灌水，反复捕捉。
2、排干田水捕捉法：在深秋稻谷收割之后，把田中鱼沟、鱼溜疏通，将田水排干，使泥鳅随水流入沟、溜之中，先用抄网抄捕，然后用铁丝制成的网具连淤泥一并捞起，除掉淤泥，留下泥鳅。天气炎热时可在早晚进行。田中泥土内捕剩的部分泥鳅，长江以南地区可留在田中越冬，次年再养；长江以北地区要设法捕尽，可采用翻耕、用水翻挖或结合犁田进行捕捉。
3、香饵诱捕法：在稻谷收割前后均可进行。于晴天傍晚时将田水慢慢放干，待第二天傍晚时再将水缓缓注入坑溜中，使泥鳅集中到鱼坑(溜)，然后将预先炒制好的香饵放入广口麻袋，沉入鱼坑(详见池塘捕捞中的食饵诱捕法)诱捕。此方法在5－7月期间以白天下袋较好，若在8月以后则应在傍晚下袋，第二天日出前取出效果较好。放袋前一天停食，可提高捕捞效果。如无麻袋，可用旧草席剪成长60厘米、宽30厘米，将炒香的米糠、蚕蛹粉与泥土混合做成面团放入草席内，中间放些树枝卷起，并将草席两端扎紧，使草席稍稍隆起。然后放置田中，上部稍露出水面，再铺放些杂草等，泥鳅会到草席内觅食。
4、笼捕法：是采用须笼或鳝笼捕捞(具体内容见工具捕捞法)。
5、药物驱捕法：通常使用的药物为茶粕(亦称茶枯、茶饼，是榨油后的残存物，存放时间不超过2年)，每亩稻田用量5－6公斤。将药物烘烧3－5分钟后取出，趁热捣成粉末，再用清水浸泡透(手抓成团，松手散开)，3－5小时后方可使用。
将稻田的水放浅至3厘米左右，然后在田的四角设置鱼巢(鱼巢用淤泥堆集而成，巢面堆成斜坡形，由低到高逐渐高出水面3－10厘米)，鱼巢大小视泥鳅的多少而定，巢面一般为脚盆大小，面积0.5－1平方米。面积大的稻田中央也应设置鱼巢。
施药宜在傍晚进行。除鱼巢巢面不施药外，稻田各处须均匀地泼洒药液。施药后至捕捉前不能注水、排水，也不宜在田中走动。泥鳅一般会在茶粕的作用下纷纷钻进泥堆鱼巢。
施药后的第二天清晨，用田泥围一圈拦鱼巢，将鱼巢围圈中的水排干，即可挖巢捕捉泥鳅。达到商品规格的泥鳅可直接上市，未达到商品规格的小鳅继续留田养殖。若留田养殖需注入5厘米左右深的新水，有条件的可移至他处暂养，7天左右待田中药性消失后，再转入稻田中饲养。此法简便易行，捕捞速度快，成本低，效率高，且无污染(须控制用药量)。在水温10－25℃时，起捕率可达90％以上，并且可捕大留小，均衡上市。但操作时应注意以下事项。首先是用茶粕配制的药液要随配随用；其次是用量必须严格控制，施药一定要均匀地全田泼洒(鱼巢除外)；此外鱼巢巢面必须高于水面，并且不能再有高出水面的草、泥堆物。此法捕鳅时间最好在收割水稻之后，且稻田中无集鱼坑、溜的；若稻田中有集鱼坑、溜，则可不在集鱼坑、溜中施药，并用木板将坑、溜围住，以防泥鳅进入。
