目前人工育苗虽然取得了成功，但由于人工育苗从受精、变态、发育生长至底播放流达到的规格，需近10个月的时间。为解决人工放流苗种问题，一个很好的办法，就是因地制宜，在海胆栖息密集区进行疏采，这样既解决了苗种问题，又能充分利用海区饵料丰富的条件，使疏采后的海胆快速生长发育。
海胆苗种区的确定，是以该海区饵料多寡、海胆栖息密度和海胆个体大小来综合考虑，一般地讲，海区饵料种类不多，生物量不大，而海胆栖息密度超过2个/平方米，其中壳径3厘米以下占优势，那么这样的海区就可以考虑为海胆苗种采捕区。
在适宜海胆底播放流的时间（一般在4月中旬至6月中旬）里进行疏采，疏采的比例应占总蕴藏量的1/3左右。
海胆苗种采捕一般采用重潜法，由专职潜水员水下进行。采捕是应按照放流规格进行，潜水员应用小铁耙把选择好的幼海胆扒进网兜，每兜数量以80-100个为宜，然后提到船上放置，并不断浇淋海水，以保持海胆的湿度。
采捕后的海胆需集中一定的数量才能进行运输和投放，所以采捕到的海胆苗种要进行暂养。暂养时最好选择自然海区，装置海胆的网袋放到海底，或悬挂在养殖浮架上，每袋苗种数量不能超过300个，暂养时间不要超过3天，然后进行运输。运输时要把海胆置放在两侧船舷，并有草帘等物遮盖，在运输途中要不断淋浇海水，运输时间不能超过8小时，这样才能保证海胆苗种有较高的成活率。
